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MethMarkerDB:癌癥DNA甲基化生物標志物數據庫

欄目:最新研究動態 發布時間:2024-03-28
DNA甲基化已成為癌癥研究中一個很有前途的生物標志物。然而,確定臨床相關生物標志物的準確基因組位置仍然是一項具有挑戰性的任務......

       DNA甲基化已成為癌癥研究中一個很有前途的生物標志物。然而,確定臨床相關生物標志物的準確基因組位置仍然是一項具有挑戰性的任務,阻礙了癌癥DNA甲基化生物標志物在臨床上的應用。整合癌癥相關WGBS數據為精確識別這些生物標志物提供了一種很有前途的方法。隨著癌癥DNA甲基化生物標志物研究的快速進展,癌癥相關WGBS數據的可用性急劇增加。然而,目前沒有專門的資源癌癥DNA甲基化生物標志物WGBS數據。
       MethMarkerDB,一個用戶友好、可訪問的數據庫,集成了724個DNA甲基化生物標志物基因,并包含來自PubMed上發表的文章和廣泛的全基因組DNA甲基化測序(WGBS)數據。該數據庫提取了這些生物標志物基因中真正具有功能的差異甲基化區域(DMR),并進行了精細的分析、整合和呈現。它包含了基于文獻的基因標記、DMR標記以及診斷和預后評估功能,為研究人員提供了強大的工具,以更好地了解和利用癌癥DNA甲基化生物標志物。

  • Search


       已搜索基因為例,選擇癌癥類型并輸入基因名稱,點擊”Search”進行搜索即可:


       結果界面顯示基因的詳細信息、甲基化信息、相關文獻等:

  • Analysis





       以Pan-cancer DMR分析為例,輸入基因名、選擇篩選標準,點擊“Search”即可:


       結果頁面展示包含該基因的多種癌癥類型:


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