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m6ADD:疾病相關m6A數據庫

欄目:最新研究動態 發布時間:2022-10-17
m6ADD 是一個包含經過實驗證實的m6A疾病數據和從高通量疾病m6A修飾譜中獲得數據的數據庫......


m6ADD 是一個包含經過實驗證實的m6A疾病數據和從高通量疾病m6A修飾譜中獲得數據的數據庫。m6A-疾病數據包括m6A基因組位置、疾病名稱、m6A蛋白、調控模式、組織/細胞系、實驗方法和數據來源。 此外,該數據庫還開發了一個預測與 24 種癌癥相關的 m6A 調節蛋白的工具。


http://m6add.edbc.org/



l  Browse

用戶可以根據基因、疾病名稱和蛋白質瀏覽條目,并單擊“詳細信息”列以獲取更多信息。



l  Search



用戶可以通過輸入關鍵字進行搜索。 對于“Species”:可以選擇“人類”或“小鼠”,或兩者兼而有之。 對于“Differential Method”:用戶可以選擇一種方法進行搜索。 需要注意的是,選擇“Intersect(M&R)”得到的結果是基于共享同一個基因,同時保留了兩種方法的結果。



l  m6A-Net

該模塊是從string database中篩選出得分大于 900 的 PPI 數據。用戶可以通過輸入不同的 m6A 基因來獲得與該基因交互的 PPI 網絡。但是該模塊中PPI 網絡最多可以顯示 30 個節點。用戶還可以點擊下面的按鈕鏈接到“DAVID”網站,對生成的基因集進行功能注釋。


 


l  m6A-Regulator

用戶可以通過選擇癌癥類型和m6A調節因子來獲得與特定癌癥中m6A調節因子功能相似的基因列表。



點擊“Network Diagram”顯示PPI網絡:



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